La estrategia de actuación del Plan Yaque se basa en la coordinación interinstitucional y la participación social. La sólida plataforma del Plan Yaque está constituida por organizaciones socias (ver Tabla de Miembros más abajo) sustentables y permanentes vinculadas con múltiples procesos y donantes, lo que le garantiza amplia capacidad de multiplicación de procesos. Esta estructura sirve como instancia de planeamiento, elaboración de programas y persecución de recursos para la aplicación de procesos en beneficio de la cuenca en diversos temas y aspectos. Sus 32 organizaciones de desarrollo distribuidas en todo el territorio de la cuenca cuentan con una amplia capacidad para realizar con eficiencia y a cualquier nivel los programas convenidos.
El Plan Yaque cuenta con una sólida membrecía compuesta por universidades, personalidades, organizaciones de desarrollo rural, empresas y expertos, que le garantizan una capacidad total para la implementación y manejo de proyectos de desarrollo rural y manejo de cuencas como mecanismo para mejorar las condiciones sociales y ambientales de la cuenca, subcuencas y microcuencas del río Yaque del Norte.